1. Eğitim Bilgi Sistemi
  2. Biyomedikal Mühendisliği (Yl) (Tezli)
  3. Protein Kimyası ve Teknolojileri (2020 - 2021)
Ders Adı Kodu Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS
Protein Kimyası ve Teknolojileri BMM 521 0 3 + 0 3 6
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Dili Türkçe
Dersin Seviyesi YUKSEK_LISANS
Dersin Türü Seçmeli
Dersin Koordinatörü Prof.Dr. GÜLNUR ARABACI
Dersi Verenler Prof.Dr. GÜLNUR ARABACI,
Dersin Yardımcıları

Biyokimya  Anabilimdalı Araştırma Görevlileri
Dersin Kategorisi Diğer
Dersin Amacı

Öğrencilere protein mühendisliği ve bunun biyoteknolojide kullanımı, proteinlerin sentezi ve biyomoleküler mekanizmalarda rolü hakkında bilgi vermek.
Dersin İçeriği

Makromoleküllerin sayısal analiz ve teknik teorileri; ayrıştırma yöntemlerinin altında yatan termodinamik ve kinetik prensipler, protein yapısı ve işlevine giriş, proteinlerin katlanması ve şaperonlar, protein stabilitesi ve döngüsü, proteazom ve protein parçalanması, ubikitinasyon ve sumoilasyon, enzim kinetiği ve çalışması, protein-protein etkileşimleri, DNA çoğalması, DNA bileşkeleri 
# Ders Öğrenme Çıktıları Öğretim Yöntemleri Ölçme Yöntemleri
1 Makromolekül kavramını ve analiz yöntemleri hakkında bilgi sahibi olur. Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma, Sınav, Ödev, Performans Görevi,
2 Öğrenciler protein biyosentezinin safhalarını açıklayacaktır Tartışma, Soru-Cevap, Anlatım, Performans Görevi, Ödev, Sınav,
3 Protein yapı ve fonksiyonlarına ekti eden parametreleri öğrenir. Tartışma, Soru-Cevap, Anlatım, Performans Görevi, Ödev, Sınav,
4 Protein yapı ve fonksiyonunu çalışmak için kullanılan teknikleri kavrar. Tartışma, Soru-Cevap, Anlatım, Performans Görevi, Ödev, Sınav,
5 Moleküler tıpta, protein mühendisliği araçlarının kullanımını öğrenir ve tartışır. Tartışma, Soru-Cevap, Anlatım, Performans Görevi, Ödev, Sınav,
6 Protein alanında yeni ve gelişmekte olan uygulamaları hakkında farkındalık; gerektiğinde bunları inceleme ve öğrenebilme becerisi Tartışma, Soru-Cevap, Anlatım, Performans Görevi, Ödev, Sınav,
Hafta Ders Konuları Ön Hazırlık
1 Makromoleküller ve analiz yöntemleri Sayfa [1] 1-29; [2] 1-38
2 Makromoleküllerin ayrıştırma yöntemleri Sayfa [1] 29-47; [2] 38-48
3 Protein kimyası ve fonksiyonu Sayfa [1] 47-58; [2] 48-59
4 Protein sentezi ve kinetiği Sayfa [1] 58-69; [2] 59-70
5 Protein işlenişi ve döngüsü Sayfa [1] 69-72; [2] 70-90
6 Proteinlerin katlanması ve şaperonlar Sayfa [1] 72-88; [2] 90-99
7 Organizmalarda protein ifadesi Sayfa [1] 88-100; [2] 99-106
8 Protein stabilitesi ve döngüsü Sayfa [1] 100-122; [2] 106-124
9 Enzim kinetiği ve çalışması Sayfa [1] 122-131; [2] 124-135
10 Protein izolasyonu ve saflaştırılması Sayfa [1] 131-143; [2] 135-146
11 Protein tanımlaması Sayfa [1] 143-160; [2] 146-155
12 Protein yapısının belirlenmesi için kullanılan teknikler Sayfa [1]160-172; [2] 155-169
13 Protein-Protein etkileşimleri Sayfa [1] 172-190; [2] 169-177
14 Moleküler tıpta protein mühendisliği Sayfa [1] 190-201; [2] 177-193
Kaynaklar
Ders Notu

Derlenmiş ders notları ve sunumlar 
Ders Kaynakları

[1] David Whitford, Proteins: Structure and Function

[2] Fundamentals of Protein Structure and Function Engelbert Buxbaum Springer 200 
Sıra Program Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Biyomedikal konularında tümleşik bir bilim ve mühendislik anlayışı X
2 Mühendislik ve biyoloji ara yüzeyindeki problemlerin çözümüne ileri matematiği uygulama yeteneği X
3 Canlı sistemler üzerinde ölçümler yapma ve sonuçları yorumlama yeteneği X
4 Çok-disiplinli takımlarda çalışma yeteneği X
5 Canlı ve cansız malzeme ve sistemlerle ilgili problemleri ele alma X
6 Biyomedikal mühendisliği alanındaki problemlerin tanımlanması ve çözümünde modern teknikleri, araçları, işlemleri ve bilgiyi kullanma yetkinliği X
Değerlendirme Sistemi
Yarıyıl Çalışmaları Katkı Oranı
1. Ara Sınav 60
1. Ödev 20
1. Performans Görevi (Seminer) 20
Toplam 100
1. Yıl İçinin Başarıya 50
1. Final 50
Toplam 100
AKTS - İş Yükü Etkinlik Sayı Süre (Saat) Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 16x toplam ders saati) 16 3 48
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 16 3 48
Ara Sınav 1 15 15
Kısa Sınav 1 10 10
Ödev 1 10 10
Performans Görevi (Seminer) 1 10 10
Final 1 20 20
Toplam İş Yükü 161
Toplam İş Yükü / 25 (Saat) 6,44
Dersin AKTS Kredisi 6