Ders Adı Kodu Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS
Moleküler Mikrobiyoloji TMB 615 0 4 + 2 5 6
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Dili Türkçe
Dersin Seviyesi Doktora
Dersin Türü Zorunlu
Dersin Koordinatörü Dr.Öğr.Üyesi TAYFUR DEMİRAY
Dersi Verenler
Dersin Yardımcıları
Dersin Kategorisi Diğer
Dersin Amacı

Moleküler Mikrobiyolojide yaşanmakta olan gelişmeler, biyoloji ve mikrobiyolojinin başka hiçbir alanında günümüzde olduğu kadar yoğun ve hızlı olmamıştır. Yaşanan salgınlar, hastalıkların tanısında kullanılan yöntemler, insan genom projesi gibi kamuoyunun dikkatini çeken bilimsel olaylar; Moleküler Mikrobiyolojiye olan ilginin artmasına neden olmaktadır. Bu dersin amacı, Moleküler Mikrobiyolojinin ilginç tarihsel gelişiminden başlayarak, günümüzde kullanılan modern moleküler metodları da kapsayan biçimde, Moleküler Mikrobiyolojinin temel kavramları, tanımlamaları,  metod ve uygulamaları konularında öğrencilere bilgi aktarımın sağlanması ve teorik uygulamalar ile edindikleri bilgileri pratikte kullanma becerilerinin geliştirilmesi amaçlanmaktadır.

Dersin İçeriği

Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarınında güvenlik ve tasarım konularından başlayarak, genetik materyalin yapısı ve özellikleri konuları, moleküler mikrobiyolojik yöntemler ile ilgili bilgilerin aktarılması, laboratuvar ortamında uygulamalı olarak günümüzde kullanılan metodlar hakkında bilgi ve beceri kazanılması konularını içermektedir. 

# Ders Öğrenme Çıktıları Öğretim Yöntemleri Ölçme Yöntemleri
1 Moleküler Mikrobiyoloji laboratuvarının dizaynı ve laboratuvar cihazlarının anlatımı ve biyogüvenlik konularını bilir. Anlatım, Soru-Cevap, Beyin Fırtınası,
2 Moleküler Mikrobiyolojinin tarihsel gelişimini ve temel kavramlarını bilir. DNA ve RNA moleküllerinin ve DNA replikasyonunun özelliklerinin bilir. Protein sentezi ve mutasyonlar hakkında bilgi sahibi olur. Beyin Fırtınası, Soru-Cevap, Anlatım,
3 Rekombinant DNA Teknolojisi anlar DNA ve RNA izolasyonu ve kullanılan yöntemleri öğrenir uygulayabilir. RFLP, Elektroforez, Sinyal Amplifikasyonu metodlarının bilir. Beyin Fırtınası, Soru-Cevap, Anlatım, Eğitsel Oyun,
4 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR), Gerçek Zamanlı (PZR) konularını bilir ve değerlendirir. Beyin Fırtınası, Soru-Cevap, Anlatım, Eğitsel Oyun,
5 Dizi Analizi ve Yeni Nesil Dizilileme ile ilgili metodlarını bilir. Beyin Fırtınası, Soru-Cevap, Anlatım, Eğitsel Oyun,
6 Moleküler Mikrobiyolojik yöntemlerin mikroorganizmaların tanımlanmasında ve hastalıkların tanısındaki kullanımın bilir. Tartışma, Beyin Fırtınası, Soru-Cevap, Anlatım, Eğitsel Oyun,
Hafta Ders Konuları Ön Hazırlık
1 Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarında Biyogüvenlik ve Laboratuvar Tasarımı Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
2 Moleküler Mikrobiyoloji Tanımlar / Moleküler Mikrobiyoloji Tarihçe Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
3 DNA ve RNA Molekülleri / Ökaryat ve Prokaryotlarda DNA Replikasyonu Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
4 Protein Sentezi / Gen Ekspresyonu / Mutasyonlar ve DNA Tamiri Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
5 Moleküler Mikrobiyolojide Çığır Açan Deneyler Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
6 Rekombinant DNA Teknolojisi ve Moleküler Klonlama Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
7 DNA ve RNA ekstraksiyonu Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
8 Elektroforez ve RFLP Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
9 Sinyal Amplifikasyonu Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
10 Hibridizasyon Northern/Southern/Dot Blot Analizleri Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
11 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) / Gerçek Zamanlı PCR Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
12 Diğer PCR türleri Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
13 Sekans analizi / Sanger sekans Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
14 Yeni Nesil Sekanslama Kaynakların, kılavuzların ve güncel bilimsel literatürün incelenmesi
Kaynaklar
Ders Notu

Moleküler Mikrobiyoloji derslerinde her derse ait sunum, görsel, video ve uygulama klavuzları dersin özelliğine göre ders öncesinde ya da ders sırasında katılımcılar ile paylaşılacaktır.

Ders Kaynakları

Fundamental Molecular Biology. Lizabeth A. Allison Department of Biology College of William and Mary Williamsburg VA 23185, USA ISBN 13: 978-1-4051-0379-4

Nester’s microbiology : a human perspective.—Eighth edition / Denise G. Anderson, University of Washington, Sarah Salm, Borough of Manhattan Community College, Deborah Allen, Jefferson College.

ISBN 978-0-07-352259-3

Published by McGraw-Hill Education, 2 Penn Plaza, New York, NY 10121.

Methods in Molecular Biology vol 216, PCR Detection of Microbial Pathogens, Edited by Konrad Sachse, DR. RER. NAT.; Joachim Frey, PhD.

Sıra Program Çıktıları Katkı Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Sağlık Bilimlerine İlişkin Bilgi Toplama ve Edindiği Bilgileri Uygulama Becerisi X
2 Bilimsel Sorgulama ve Hipotez Oluşturma Becerisi X
3 Literatür Tarama ve Değerlendirme Becerisi X
4 Deney Tasarlama, Yapma, Verileri Analiz Edebilme ve Değerlendirebilme Becerisi X
5 Deneysel Araç ve Gereç Tanıma ve Uygun Şekilde kullanabilme Becerisi X
6 Disiplinler-arası Takım Çalışması Yapabilme Becerisi X
7 Tıbbi Problemleri Tanıma, Formülize Etme ve Çözme Becerisi X
8 Araştırmalarda ve Veri Analizlerinde Etkin Bilgisayar Kullanabilme Becerisi X
9 Yapılan deneysel çalışmaların Bilime Sağlayacağı Katkıyı Anlama Becerisi X
10 Etkin Yazılı ve Sözlü İletişim/Sunum Becerisi X
11 Mesleki ve Etik Sorumluluğu Anlama ve Uygulama Becerisi X
12 Yaşam Boyu Öğrenimin Önemini Kavrama ve Uygulama Becerisi X
13 Tıbbi mikrobiyoloji Eğitiminde Temel Kavramları Tanıma Becerisi X
14 Temel Kavramları Merkeze Alarak Etik Problemlere Yaklaşma Becerisi X
Değerlendirme Sistemi
Yarıyıl Çalışmaları Katkı Oranı
1. Ara Sınav 70
1. Ödev 30
Toplam 100
1. Final 50
1. Yıl İçinin Başarıya 50
Toplam 100
AKTS - İş Yükü Etkinlik Sayı Süre (Saat) Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 16x toplam ders saati) 16 6 96
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 16 2 32
Ara Sınav 1 4 4
Ödev 1 4 4
Final 1 4 4
Toplam İş Yükü 140
Toplam İş Yükü / 25 (Saat) 5,6
Dersin AKTS Kredisi 6