| Ders Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| Proteom Analizi | BYK 643 | 0 | 3 + 0 | 3 | 6 |
| Ön Koşul Dersleri | |
| Önerilen Seçmeli Dersler | |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Seçmeli |
| Dersin Koordinatörü | Prof.Dr. GÜLNUR ARABACI |
| Dersi Verenler | |
| Dersin Yardımcıları | Biyokimya Anabilimdalı Araştırma Görevlileri |
| Dersin Kategorisi | Diğer |
| Dersin Amacı | Hastalıkların teşhisinde ve hücre düzeyinde anormalliklerin belirlenmesinde kullanılan proteom analizlerini anlaşılıp yorumlanmasını yardımcı olur. Ayrıca, biyokimya, tıp ve biyoteknolojide proteomun nasıl uygulanabildiği hakkında bilgilendirir. |
| Dersin İçeriği | Giriş-proteom araştırmalara genel bakış, protein analizinde iki yönlü elektroforez (2-D), proteinlerin enzimatik parçalanması ve peptidlerin HPLC ile ayrılması, peptid ve proteinlerin dizi analizleri, proteom analizlerinde biyoinformatik, , proteomik analizlerde model sistemler |
| # | Ders Öğrenme Çıktıları | Öğretim Yöntemleri | Ölçme Yöntemleri |
|---|---|---|---|
| 1 | Proteom analizinde kullanılan ikiyönlü (2-D) gel elektroforezini yorumlar | Anlatım, Soru-Cevap, | Sınav, Ödev, |
| 2 | Blotlama ve ümin boyama yöntemlerini tanır | Anlatım, Soru-Cevap, | Sınav, Ödev, |
| 3 | Proteinlerin parçalanmasından oluşan peptitlerin HPLC ile analizinlerini yorumlar. | Anlatım, Soru-Cevap, Problem Çözme, | Sınav, Ödev, |
| 4 | Peptitlerin kütle spektroskopisini analizler | Anlatım, Soru-Cevap, | Sınav, Ödev, |
| 5 | Proteomikteki model sistemleri tanır | Anlatım, Soru-Cevap, | Sınav, Ödev, |
| 6 | Proteinlerin yapı analizlerinde en son gelişmelerde kullanılan yöntemleri sorgular | Anlatım, Soru-Cevap, | Sınav, Ödev, |
| Hafta | Ders Konuları | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Proteom araştırmalara genel giriş | [1] Sayfa 7-20 |
| 2 | Protein analizinde iki yönlü elektroforez (2-D) | [1] Sayfa 21-28 |
| 3 | Blotlama ve immün boyama | [1] Sayfa 29-38 |
| 4 | Proteinlerin enzimatik parçalanması ve peptidlerin HPLC ile ayrılması | [1] Sayfa 39-46 |
| 5 | Peptit ve proteinlerin dizi analizleri | [1] Sayfa 47-56 |
| 6 | Protein ve peptidlerin kütle spektrumu | [1] Sayfa 57-64 |
| 7 | Post-translasyonel değişiklikler | [1] Sayfa 65-75 |
| 8 | Difrensiyal proteom analizlerinde biyoinformatik | [1] Sayfa 76-96 |
| 9 | ARA SINAV | |
| 10 | Proteomik çalışmalarda hücre kültürü | [1] Sayfa 97-105 |
| 11 | Proteomik analizlerde model sistemler (Fareler üzerine) | [1] Sayfa 106-116 |
| 12 | Proteom analizi uygulamalarından, insanın tümörlü proteinlerin belirlenmesi, tanınması ve karakterize edilmesi | [1] Sayfa 117-124 |
| 13 | Proteomik çalışmalarda kararlı izotop işaretleme ile proteom analizleri | [1] Sayfa 125-130 |
| 14 | Proteomic uygulamalar ve yeni teknolojiler | [1] Sayfa 131-4 |
| Kaynaklar | |
|---|---|
| Ders Notu | [1] A. TELEFONCU, J. SALNIKOW, F. ZİHNİOĞLU and A. KILIÇ " Proteom Analizi Metodlar ve Uygulamaları" Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi Basımevi, 2002, Çanakkale |
| Ders Kaynakları | [2] D. C. Liebler Introductiın to PROTEOMICS Human press, 2002,Tottava, N.J. USA |
| Değerlendirme Sistemi | |
|---|---|
| Yarıyıl Çalışmaları | Katkı Oranı |
| 1. Ödev | 20 |
| 1. Performans Görevi (Seminer) | 20 |
| 1. Ara Sınav | 60 |
| Toplam | 100 |
| 1. Yıl İçinin Başarıya | 50 |
| 1. Final | 50 |
| Toplam | 100 |
| AKTS - İş Yükü Etkinlik | Sayı | Süre (Saat) | Toplam İş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 16x toplam ders saati) | 16 | 3 | 48 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) | 16 | 3 | 48 |
| Ara Sınav | 1 | 15 | 15 |
| Ödev | 1 | 10 | 10 |
| Performans Görevi (Seminer) | 1 | 10 | 10 |
| Final | 1 | 20 | 20 |
| Toplam İş Yükü | 151 | ||
| Toplam İş Yükü / 25 (Saat) | 6,04 | ||
| Dersin AKTS Kredisi | 6 | ||